Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms