Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms