Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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