Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms