Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms