Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIRT1Q96EB6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms