Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNRQ92752 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNRQ92752 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNRQ92752 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNRQ92752 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNRQ92752 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRQ92752 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRQ92752 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRQ92752 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms