Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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PTPRUQ92729 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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PTPRUQ92729 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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PTPRUQ92729 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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PTPRUQ92729 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
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PTPRUQ92729 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
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PTPRUQ92729 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
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PTPRUQ92729 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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