Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113Q902F9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms