Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms