Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms