Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms