Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms