Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC71Q8N4P6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms