Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms