Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAPQ7Z569 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms