Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms