Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms