Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP53Q70EK8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP53Q70EK8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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