Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms