Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms