Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms