Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms