Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms