Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms