Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMBOX1Q6NT76 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms