Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT80Q6KB66 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265 ms