Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms