Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms