Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC9A4Q6AI14 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms