Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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