Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GKAP1Q5VSY0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GKAP1Q5VSY0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms