Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CELF3Q5SZQ8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms