Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITRM1Q5JRX3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms