Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALFQ53S48 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms