Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms