Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL38Q2WGJ6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms