Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC57Q2TAC2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms