Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms