Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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