Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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