Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
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COL24A1Q17RW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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COL24A1Q17RW2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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COL24A1Q17RW2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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COL24A1Q17RW2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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COL24A1Q17RW2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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COL24A1Q17RW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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COL24A1Q17RW2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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