Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TXNRD1Q16881 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNRD1Q16881 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNRD1Q16881 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNRD1Q16881 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNRD1Q16881 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNRD1Q16881 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms