Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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FOXD1Q16676 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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FOXD1Q16676 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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FOXD1Q16676 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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FOXD1Q16676 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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