Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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