Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK5Q16478 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms