Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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