Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms