Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F4Q16254 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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