Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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